盈科从小聪慧，万历五年(1577)人县学为生员，十三年(1585)乡试中举，“自为诸生，名已隆隆起”但是，此后于万历十四年、十七年两次赴京参加进士考试，皆不第而归。万历二十年(1592)三月，与袁宏道同榜进士及第。八月，授长洲(今江苏吴县)县令。长洲属三吴，“赋税之重，甲于天下”，江盈科同情人民，常因催科不力而遭“长官詈骂”。为缓解人民“京解诸役”之苦，置役田二千余亩以资役费。任职六载，贤令名声远播。万历二十六年(1598)，先报吏部主事，旋因李应策劾奏江盈科“以征赋不及格”而改官大理寺正。是年冬离京，奉命恤刑滇黔。两年后升户部员外郎并主试四川。三十二年七月，擢四川提学副使。次年八月，病逝于四川。后归葬桃源苏溪。
江盈科体察下情，兴利除弊，是一位难得的贤吏。他著《王者所天在民论》，认为民为王者之天，王者之心”。王权表露形迹，天下民众总是设法逃避；而民权表现的是心，却无迹可寻，民心向背，关系社稷的存亡，力量无比。因此，为官者必然“不敢忽民，不忍残民，不能一瞬息忘民”。他批评当时朝政腐败：“宫中黄金高如斗，道旁死人不如狗。民苦君乐不忍闻，分明藉资与敌手”。袁宏道赞叹江盈科“痛民心似病，感事泪成诗”。在文学上，江盈科参与创立公安派，贡献巨大。他为文主张“元神活泼”，写真性、真情、真我，被袁氏兄弟称为诗文“大家”。传世著作有今人黄仁生博士辑校、由岳麓书社出版的《江盈科集》。